Přednášková a publikační činnost

• Školící místa v NRL pro patogenní aktinomycety OLMI ONT, a.s.
• Spolupráce s odbornými společnostmi ČLS
  • Přednášky realizované v rámci seminářů Společnosti pro lékařskou mikrobiologii České lékařské společnosti JEP v Praze
• Knihy Josefa Scharfena ml.

Knihy

Nokardióza

Doporučená metoda mikrobiologické diagnostiky nokardiózy s přehledem léčby nokardiózy a návrhem standardního operačního postupu

Mikroaerofilní aktinomycety a aktinomykóza

Stejně jako nokardie, jsou i aktinomycety podivuhodné mikroorganizmy, pokládané za jedny z nejstarších živých obyvatelů naší planety. Aktinomycety patří mezi bakterie, do poloviny minulého století však byly pokládány za mykotické organizmy. Tento mylný předpoklad se odráží v názvu rodu (Actinomyces) i v označení onemocnění (aktinomykóza). Některé aktinomycety totiž vytvářejí větvící se vlákna podobná myceliím mykotických organizmů, na rozdíl od nich však postrádají diferencované jádro, mitochondrie, a chitin nebo glukany v buněčné stěně.

Diferenciální diagnostika v klinické mikrobiologii

Velmi přehledně údaje týkající se klinické mikrobiologie z mnoha úhlů pohledu. Za velmi prospěšné lze považovat komplexní a přehledné zpracování, které bezesporu usnadní orientaci v oblasti klinické mikrobiologie.

Publikace

• Josef Scharfen, jr., + Josef Scharfen, sen., Dag Harmsen, Martin Bunček, Pavla Urbášková: Doporučena metoda k předběžné identifikaci nokardií podle fenotypu rezistence. Zprávy CEM (SZÚ Praha) 2007, 3, 16. http://www.szu.cz/…/default.htm
• Josef Scharfen, jr.: Nokardie – smrtící krásky. Živa, 2007, 50, 2.
• Josef Scharfen, jr.: Nokardie podruhé – za historií Národní referenční laboratoře v Trutnově. Živa, 2007, XXVII, 2. http://www.rozhlas.cz/…prava/346470
• Scharfen, J., jr.: Nocardia: Overview, polyphasic identification and antibiotic resistance phenotypes. The Association of Clinical Pathologists Yearbook (UK) 2009, p.41. Sborník výročního zasedání v roce 2008 v Praze.
• Scharfen, J., ml.: Sepse vyvolané grampozitivními koryneformními mikroorganismy a jejich léčba. 17.ročník mezioborového semináře Třeboň, 2009. 12.1.-14.1.2009.
• Scharfen, J., Grampozitivní koryneformní organismy jako vyvolavatelé posttransplan­tačních komplikací. Seminář Společnosti pro lékařskou mikrobiologii ČLS, Lékařský dům, Praha, 2009; 3.2.2009.
• Scharfen, J., ml., Plíšek, S., Urbášková, P., Morávková, M., Hobza, V., Bunček, M., Ježek, P., Paterová, P.: Nocardia farcinica z abscesu mozku u imunosuprimo­vaného pacienta. Zprávy epidemiologie a mikrobiologie, SZÚ, Praha, 2009; 18(5).
• Scharfen, J., ml., Bergerová, T., Bunček, M., Urbášková, P., Reischig, T., Stárková, H.: První izolace Nocardia transvalensis v České republice z abscesu mozku u pacienta po transplantaci ledvin. Zprávy epidemiologie a mikrobiologie, SZÚ, Praha, 2009; 18(9).
• Scharfen, J., jr., Morávková M., Bunček M., Hobza V., Plíšek S., Urbášková P., Sedláček I., Žemličková H., Stárková H., Paterová P. Nocardia farcinica jako původce abscesu mozku u pacienta s intersticiálním onemocněním plic. Epidemiol.Mikro­biol. Imunol.2010, 59, 1, 13–20.
• Chroňáková A., Scharfen, J., ml., Ježek, P., Krištůfek, V.: Streptomycete community from the clinical samples. Their Properties and signification. Abstract Book. 15th International Symposium on the biology of actinomycetes. 20.-25. August.2009­. Shanghai. Chi­na.
• Scharfen, J., ml., Morávková M, Bunček, M., Hobza V., Plíšek S., Urbášková P., Sedláček I., Žemličková H., Stárková H., Paterová, P. Nocardia farcinica jako původce abscesu mozku u pacienta s intersticiálním onemocněním plic. Epidemiol. Mikrobiol. Imunol. 59, 2010, č.1, str.13–20.
• Josef Scharfen, ml.: Diagnostika onemocnění vyvolaných Rothia dentocariosa. Diagnosis of the diseases caused by Rothia dentocariosa. Zprávy epidemiologie a mikrobiologie (SZÚ, PRAHA) 2010;19 (5) str. 144–147.
• Josef Scharfen, ml.: Vláknité „kontaminanty“ v mykobakteri­ologické laboratoři, jejich kultivace, identifikace a klinický význam. A filamentous „contaminants“ in the mycobacteriology laboratory; their culture, identification and clinical significance. Klinická mikrobiologie a infekční lékařství. 2010, 16 (2) str.48 – 57.
• Plíšek S., Honegr K., Kapla J., Scharfen J.ml., Prášil P., Hobza V., Taláb R.,Eliáš P., Ryška P., Morávková M., Plíšková L.: Nokardiové abscesy mozku – přehledný článek a kazuistika. Brain abscesses caused by Nocardia – review with a case report. Česká a Slovenská neurologie a neurochirurgie 2010. Spoluautor.
• Eva Chudáčková, E., Geigerová, L., Hrabák, J., Bergerová, T., Liška, V., Scharfen, jr., J. Seven isolates of Actinomyces turicensis from patients with 1 surgical infections of 2 anogenital area in a Czech Hospital. (Sedm izolátů Actinomyces turicensis od pacientů s chirurgickými infekcemi anogenitální krajiny v Českých nemocnicích) JCM Accepts, published online ahead of print on 26 May 2010, J. Clin. Microbiol. doi:10.1128/ JCM.00548–10.
• Krištůfek V, Nováková L, Chroňáková A, Dostálková I, Ježek P, Scharfen J. Rezervoáry bakteriální antibiotické rezistence v půdě, městských sedimentech a v lidském těle. 25. Kongres Československé společnosti mikrobiologické s mezinárodní účastí. Stará Lesná, Vysoké Tatry, Slovensko. Sborník kongresu 2010.
• Plíšek S., Honegr K., Kapla J., Scharfen J., Eliáš P., Morávková M. Nokardiové infekce mozku. NEURO-SKI Harrachov, 2010, sborník.
• Hrabák J, Bunček, M, Dendis M, Horváth R, Chroňáková A, Libra A., Nešvera J, Pantůček R, Piskunová N, Plíšková L, Růžička F, Sauer P, Sedláček I, Trubač P, Žampachová E, Žemličková H, Scharfen J. Aplikace metod molekulární genetiky v klinické mikrobiologii: Zpráva z jednání Pracovní skupiny molekulární mikrobiologie – TIDE. Application of molecular genetic methods in clinical microbiology: Report of proceedings of Working group for molecular microbiology – TIDE. Epidemiologie, mikrobiologie, imunologie., Praha, Česká lékařská společnost J. E. Purkyně. ISSN 1210– 7913, 2010, vol. 59, no. 3, s. 103–106. Spoluautor.